PCR ARRAY应用指南

文章信息：ADAR1 Facilitates KSHV Lytic Reactivation by Modulating the RLR-Dependent Signaling Pathway

Huirong Zhang, Guoxin Ni, Blossom Damania

doi: 10.1016/j.celrep.2020.107564

发表杂志：Cell Reports（IF=7）

材料：人iSLK.219细胞，TREx BCBL1-RTA细胞，293FT细胞

实验方法：KSHV病毒感染iSLK.219细胞和BCBL1-TREx-RTA细胞，转染siRNA，后用含有84个目的基因的人类干扰素和受体PCR阵列进行qPCR检测

实验目的：KSHV病毒裂解再激活过程中，ADAR1在信号通路中的作用

使用芯片：人类干扰素和受体PCR阵列

文章信息：inhibitors of the Histone Methyltransferases EZH2/1 Induce a Potent Antiviral State and Suppress Infection by Diverse Viral Pathogens

Jesse H. Arbuckle, Paul J. Gardina, David N. Gordon, Heather D. Hickman, Jonathan W. Yewdell, Theodore C. Pierson, Timothy G. Myers, Thomas M. Kristie

DOI: 10.1128/mBio.01141-17

发表杂志：MBIO（IF=6）

材料：HFF细胞

实验方法：先用HSV病毒感染HFF细胞，再用EZH2 / 1的抑制剂处理HFF细胞，后用IFN qPCR芯片检测细胞内差异基因，再通过转录组测序分析抗病毒机制

实验目的：确定IFN和IFN受体PCR阵列中差异表达的基因

使用芯片： IFN qPCR芯片

文章信息：Definition of miRNA Signatures of Nodal Metastasis in LCa: miR-449a Targets Notch Genes and Suppresses Cell Migration and Invasion

Hiromichi Kawasaki, Takashi Takeuchi, Filippo Ricciardiello, Angela Lombardi, Elia Biganzoli, Marco Fornili, Davide De Bortoli, Massimo Mesolella

doi: 10.1016/j.omtn.2020.04.006

发表杂志：Molecular Therapy-Nucleic Acids（IF=5）

材料：淋巴结转移（N=23）和无淋巴结转移（N=23）的LCa患者及其邻近的正常对照组（N=30）收集的临床LCa组织样本

实验方法：通过含有309个miRNA的qPCR ARRAY对组织样品检测，分析LCa组织中差异的miRNA

实验目的：确定LCa组织中的特异表达的miRNA

使用芯片：人miRNA ARRAY

文章信息：Negative regulation of lncRNA GAS5 by miR-21

Z Zhang, Z Zhu, K Watabe, X Zhang, C Bai, M Xu, F Wu & Y-Y Mo

发表杂志：Cell Death & Differentiation （IF=8）

材料：乳腺癌MCF-7细胞和MDA-MB-231细胞，正常细胞MCF-10A

实验方法：通过83个人类疾病相关IncRNA阵列检测miR-21对IncRNA表达的影响。

实验目的：确定miR-21是否可以调节lncRNA表达

使用芯片：人类疾病相关IncRNA阵列

文章信息：Bromodomain and Hedgehog Pathway Targets in Small Cell Lung Cancer

Gurmeet Kaur,1 Russell A. Reinhart, Anne Monks, David Evans, Joel Morris, Eric Polley, and Beverly A. Teicher

doi: 10.1016/j.canlet.2015.12.001

发表杂志：Cancer Letters（IF=6）

材料

实验方法：采用96孔自定义PCR array，对24株小细胞肺癌细胞株进行了Hedgehog、Notch、肺癌和stem-like基因的表达检测。

实验目的：筛选MYC靶基因

使用芯片：定制芯片